TT   G    CA    -    AT    ---   A    GTTAAGTGATGTGGAGGATGATGTGGCACCAATTAAGCAATTGTTAAGAATGTAGGAATACTTGTTTATTTAGCAAGTCAATTAGAAATGCCACCTAGGCAAATTGTTATACTTTTCAAGAAATACATTTATGAATAGAAAATAAATTTAAA
  AGA CATC  CATC CCTA  TTTT   TAG AATT                                                                                                                                                        
  ||| ||||  |||| ||||  ||||   ||| ||||                                                                                                                                                        A
  TCT GTAG  GTAG GTTT  TTAA   ATC GCTA                                                                                                                                                        
AT   A    AG    A    --    GTA   -    AAAATTAGTTTTGAAATAGCGGTGTAGTTGTTGAAAACAAGGTGTTAAAGATTGGAGGAGGTAGGGTGACTAACTAATCGTTAAAGATTAGTAGTAAAAATGTTTGTTTGTGTTGTTTTTACTTGGTTAGTTTTAGTAATCTATAATAAATA